长江上游林业生态工程四川省重点实验室是在1995年组建的校级重点实验室的基础上，经过10余年的建设，于2008年9月获四川省科学技术厅批准成立，建设依托单位为四川农业大学，依托的林学学科是国家林草局重点建设学科。2025年，按照省厅实验室重组工作要求，实验室联合绵阳师范学院和四川林业勘察设计研究院有限公司，优化重组建设“长江上游森林生态与保育四川省重点实验室”，2025年7月3日，四川省科学技术厅发文实验室顺利重组。

长期以来，实验室针对长江上游林业生态系统在国家生态与经济安全中的战略地位，以及困扰林业可持续发展的水土流失、生态退化、人地关系紧张等突出生态环境问题，以服务于国家大型生态工程建设和地方经济建设为目标，重点开展了低效林改造理论及技术、工业原料林丰产栽培技术体系、水土流失区综合治理理论及技术、以及典型生态系统对全球气候变化和极端灾害气候事件的响应与适应等科学研究、技术攻关和试验示范。

本实验室在开展科学研究的同时，加强了实验平台建设，已拥有6套控制环境植物生长室、智能人工气候室、气相色谱仪、气质联用仪、光合作用-土壤呼吸测定仪、定时定量PCR仪、生物显微镜、超临界CO₂萃取装置、膜分离装置、低压层析系统、树木年轮分析系统、压力膜仪、植物生理生态监测系统、BAPS土壤氮循环监测系统、遥感影像处理软件ENVI、荧光分光光度计、原子分光光度计、粒度分析仪、细胞融合仪、总有机碳分析仪、便携式光合作用测定仪等配套仪器。

实验室自成立以来，共获省部级奖20余项，主编或参编国内外论著30余部，新品种30余个，发明专利100余件，在国内外学术刊物上发表论文1000余篇，培养博士后、博士和硕士研究生500余名。这些研究成果为长江上游生态屏障建设和林业产业化发展提供了重要的理论和技术支撑。实验平台建设是科学研究和人才培养的基础，作为林学院科研平台建设的组成部分，已成为特色和优势明显、西南地区领先和国内一流的高层次人才培养基地和科学研究基地。