长江上游林业生态工程省级重点实验室是在1995年组建的校级重点实验室的基础上，经过10余年的建设，逐步发展起来的四川省教育厅重点实验室和四川省重点实验室。长期以来，本实验室针对长江上游林业生态系统在国家生态与经济安全中的战略地位，以及困扰林业可持续发展的水土流失、生态退化、人地关系紧张等突出生态环境问题，以服务于国家大型生态工程建设和地方经济建设为目标，重点开展了低效林改造理论及技术、工业原料林丰产栽培技术体系、水土流失区综合治理理论及技术、以及典型生态系统对全球气候变化和极端灾害气候事件的响应与适应等科学研究、技术攻关和试验示范。

本实验室在开展科学研究的同时，加强了实验平台建设，已拥有6套控制环境植物生长室、智能人工气候室、气相色谱仪、气质联用仪、光合作用-土壤呼吸测定仪、定时定量PCR仪、生物显微镜、超临界CO₂萃取装置、膜分离装置、低压层析系统、树木年轮分析系统、压力膜仪、开路式CO₂/H₂O度分析仪、植物生理生态监测系统、BAPS土壤氮循环监测系统、遥感影像处理软件ENVI、荧光分光光度计、原子分光光度计、粒度分析仪、细胞融合仪、总有机碳分析仪、便携式光和作用测定仪等配套仪器。

近5年来，承担国家级科研项目10余项，省部级科研项目20余项，出版学术专著6部，发表学术论文300余篇，获省部级科技进步奖7项，审定林木新品种4个，获授权专利2项。培养博士、硕士毕业生100余名。这些研究成果为长江上游生态屏障建设和林业产业化发展提供了重要的理论和技术支撑。实验平台建设是科学研究和人才培养的基础，作为林学院科研平台建设的组成部分，已成为特色和优势明显、西南地区领先和国内一流的高层次人才培养基地和科学研究基地。